标准灵能系统认为心灵能量和魔法可以互相作用，它们受到"解除魔法"法术或"解除灵能"异能时同样计算。法术抗力抵抗异能时如同抵抗法术一样有效，而异能抗力抵抗法术时也如同抵抗异能一样有效。同样地，协助抵抗影响心灵效果的法术对具有影响心灵效果的异能同样有效，反之亦然。例如，一条有18的法术抗力(SR)的龙在对抗异能时同样有18的异能抗力。
这么处理灵能有很多原因，但最重要的原因是为了游戏平衡。D&D核心游戏中已经规划好了如何处理复杂的魔法。任何偏离这些规则太远的系统都有可能成为无法和游戏的其他部分整合的"附加"系统。
然而，有些人渴望这种区分。比方说你正扮演的人物处于新的没有和魔法整合的灵能系统中，这个战役专门为魔法和施法者做了设计。当你出现在该场景中，你在本地，甚至全世界范围内是孤独的灵能生物。没有什么能阻止你或抵抗你奇异的精神能量(尽管豁免检定仍正常生效)。有利必有弊——对你而言，魔法是不可阻挡的奇异能量，你不能用你的异能抵消或妨害魔法。你唯一可行的办法是交一两个施法者朋友，或者获取能以某种方式对抗魔法的附魔物品。
本节提供了如何分开魔法和灵能的指导方针。记住这只是处理灵能的一种可选方式，只有DM愿意为平衡游戏秩序做额外准备时才应该引入。
解除：对心灵异能、能力或物品施展"解除魔法"是无效的。同样地，对法术、魔法效果或物品展现的"解除灵能"只是一些声光。
效果减弱：可变的，解除魔法对灵能的效果较差，而解除灵能对魔法的效果较差。在用它们对相反的能量进行解除检定时，检定得到-4减值。
影响心灵的法术和异能：有些法术和特殊能力保护心智的以对抗魔法魅惑或强迫效果，但它们无法抵抗同样效果的心灵版本。例如，精灵对抗魔法"魅惑人类"时意志豁免检定拥有+2种族加值，但对抗灵能魅惑术时就没有该加值。而对于心灵附魔系异能有抗性的生物对附魔系法术而言较为脆弱。
效果减弱：可变的，生物会得到对于另一种效应一半数值的抗力。例如，精灵在对抗心灵附魔系的异能时得到+1加值。
死魔法/反灵能区域："反魔法力场"无法阻碍灵能，而"反灵能力场"也无法妨害魔法。
效果减弱：可选的，灵能在死魔法区有一定几率被阻碍，反之亦然。每轮，一个相反的效果只有50%的几率不受阻碍。若其被阻碍，则其效果将被视为被压制1d4轮，在该效果的剩余时间中其不会再受阻碍。
法术和异能抗力：恶魔的法术抗力也不能抵挡1级灵能人物展现的最低级异能(尽管豁免检定作用如常)。特别强力的灵能生物地异能抗力对异能有效却对法术毫无用处。
效果减弱：可选的，法术抗力会对异能生效，而异能抗力会对法术生效，虽然在这两种情况下法术抗力和异能抗力都被视为比实际值少10。因此，具有法术抗力25的生物会如同具有异能抗力15。
生物"进化"：在心灵异能运作但法术抗力却不能抵抗异能的世界中，强力生物如果不同时拥有法术抗力和异能抗力便会很快绝种。对于纯灵能生物也一样，他们对自己操控的这种能量有着特殊防护力却对魔法毫无办法。使用本变体规则时可以利用以下修正。
类似于上文的效果减弱选项，给MM中所有法术抗力至少有10的生物等于SR-10的异能抗力。例如，有18的法术抗力的龙应该有8的异能抗力。给MM中所有拥有心灵异能的生物等同于其法术抗力的异能抗力。
本书第八章"怪物"中介绍了一些拥有异能抗力的生物。在该变体规则下，给异能抗力至少有10的生物等于PR-10的法术抗力。
专门的法术和异能：和前述生物"进化"一样，必须有一些专门的法术和异能让这两种相异的能量有限度地彼此影响。例如，施法者应该有"解除灵能"法术，但远不如"解除魔法"对付等效魔法那样强力。同样地，心灵术士可能也开发了"消解魔法"异能，但也不如"消解灵能"对付等效异能那样有效。
一般地，任何能够影响对方能量的法术或异能相比类似名称的"本职"法术或异能应该有更高能级和较低效果。以下是一些例子。
"侦测灵能"：这道二级法术和"侦测魔法"法术作用完全类似，但能级更高且是用来侦测灵能的。
"侦测魔法"：这道二级异能和"侦测灵能"异能作用完全类似，但能级更高且是用来侦测魔法的。
"解除灵能"：这道五级法术如同比真实施法者等级低两级的的施法者施展"解除魔法"一样，但是是用来对付灵能的。
"消解魔法"：这道五级异能如同比真实显能者等级低两级的的显能者展现"解除灵能"一样，但是是用来对付魔法的。